我有8例病人rna seq的bam資料,要進行差異分析,找出

2021-04-17 11:57:30 字數 739 閱讀 4950

1樓:

dna分子是雙鏈

來的,是經典的雙源螺旋結構,它是半保留複製,複製時邊解旋邊複製.是遺傳

物質.rna也可以做遺傳物質,但是是單鏈的.dna在表達時先根據鹼基互補配對原則配成信使rna,再由一條信使rna根據鹼基互補配對原則配成轉錄rna,完成翻譯工作.

並且dna由a、t、c、g四種鹼基的脫氧核糖核酸構成,rna由a、u、c、g四種核糖核酸構成。

差異基因分析pvalue,fdr是怎麼計算的

2樓:迷途崽崽

在利用rna-seq資料比較分析兩個樣品中同一個基因是否存在差異表達的時候,一般選取兩個標準:

i)foldchange

foldchange,很容易理解了。就是兩樣品中同一個基因表達水平的變化倍數。可以用rpkm值來計算,關於rpkm的計算方法,請參考

ii)fdr校正後的p-value,即q-valuefdr值的計算方法如下:

1)對每個基因進行p-value的計算

假設觀測到基因a對應的reads數為x,已知在一個大文庫中,每個基因的表達量只佔所有基因表達量的一小部分,在這種情況下,p(x)的分佈服從泊松分佈。已知樣本一中唯一比對到基因組的總reads數為n1,樣本二中唯一比對到基因組的總reads數為n2,樣本一中唯一比對到基因a的總reads數為x,樣本二中唯一比對到基因a的總reads數為y,則基因a在兩樣本中表達量相等的概率可由以下公式計算:

我有好多尾數都是8的百元鈔票,最少的都有8請問值錢不

朋友bai你好。05班紙幣發du 行量巨大。要至少尾6同以zhi上才有明顯dao的增值空間的回。3個或4個一樣答的建議用掉。5個一樣的話全新的可以留著。舊的一樣用掉。沒有什麼收藏價值的。紙幣注意儲存,其新舊程度對 的影響很大。建議購買紙幣保護袋或刀幣盒,以便對紙幣起到有效的保護,實在不行就將紙幣放在...

非常有名的古詩有8句的有哪些 我要寫來參加比賽求最好的

詠梅居士 1.崔顥的黃鶴樓,傳說李白登黃鶴樓,目睹此詩,大為折服。說 眼前有景道不得,崔顥題詩在上頭。嚴滄浪也說唐人 七言律詩,當以此為第一。足見詩貴自然,縱使格律詩也無不如此。黃鶴樓 唐 崔顥 昔人已乘黃鶴去,此地空餘黃鶴樓。黃鶴一去不復返,白雲千載空悠悠。晴川歷歷漢陽樹,芳草萋萋鸚鵡洲。日暮鄉關...

我認識比我大12歲的男人,離異有8歲的兒子,我21歲,他對我很好,可是我又不敢接受他

見識不在同一個階段,這樣的婚姻很難堅持到底。除非他有一定的經濟基礎,且你願以他為中心的生活,這種情況還能長久。只要你們相愛,孩子雖然有麻煩,只要你對他好,難事也只是暫時的。問題你們真的是愛情嗎?還是他走進第一個對你好的男人,一定要弄清楚。真愛,年齡不應該成問題。合適才是最主要的問題。除了你的感覺之外...