可以做Hiseq 2500包lane,測序讀長PE 101嗎

2021-04-17 22:07:42 字數 1232 閱讀 5974

1樓:子禾

illumina的測序儀是以flowcell進行測序的,一般的一張flowcell是一個run,像hiseq2500的話是2張flowcell,也就是一次運版行的測序量。每張flowcell上通權常都有多個通道,每個通道可以單獨測不同的樣品,這樣的通道就是lane。hiseq2500的一張flowcell有8條通道,也就是8個lane。

如果上機前使用cbot的話可以每條lane都跑不同的樣品,互不干擾,如果直接上機進行快速模式的話就無法區分不同樣本了。

illumina測序技術術語 lane和run是什麼意思

2樓:匿名使用者

illumina的測序儀是以flowcell進行測序的,一般的一張flowcell是一個run,像hiseq2500的話是2張flowcell,也就是一次執行專的測序量屬。每張flowcell上通常都有多個通道,每個通道可以單獨測不同的樣品,這樣的通道就是lane。hiseq2500的一張flowcell有8條通道,也就是8個lane。

如果上機前使用cbot的話可以每條lane都跑不同的樣品,互不干擾,如果直接上機進行快速模式的話就無法區分不同樣本了。

高通量測序 illumina hiseq 2000 和roche454 兩種平臺的區別

3樓:土豆檸檬絲

他們復是兩家不同公司的測序制平臺

1.原理

illumina的hiseq2000和454都是通過單序列的擴增放大訊號,只是hiseq2000中間有橋式擴增,可以兩頭測序。測序長度來講,hiseq2000一般為1x100和2x100的模式,而454平均500bp左右,最長700左右,測序準確度來講hiseq的測序準確度稍高一些,454由於在測序的過程每次是加一種鹼基,所有如果是單鹼基重複,比如aaaa,那麼區分幾個a的準確性就會下降。

2.資料分析和應用方向

資料分析相差不大,只是不同的軟體,應用方面兩者各有優勢,hiseq2000資料適應性更高。454一般是巨集基因組種群丰度測序上應用更好一些,不過illumina也有miseq代替。

3.通量和**

hiseq2000的通量要高一些,**比454便宜很多。

綜合來講454現在應用面比較窄了,所以在市場上現在也慢慢被代替掉了。現在耗材和試劑也很快就停服務了。

不過hiseq現在市場上也都2500居多了,並且現在也有新的的技術更新的3000和4000。說實話現在hiseq2000也很少了。

2500組裝電腦配置單,什麼都可以玩,綜合點的

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