測序中P1接頭有什麼用?用在哪,高通量測序中P1接頭的作用及連線接頭反應原理

2021-03-03 20:32:47 字數 1744 閱讀 2361

1樓:土豆檸檬絲

要了解p1接頭有什麼用,首先要知道p1接頭是什麼?

p1接頭是二代測序中加入到接頭序列,主要包括和flow cell上互補的olgo序列和測序引物(一般barcord序列在p2接頭上)

用處:1,與flow cell上的序列互補結合從而使待測序列結合到flow cell上 2.具有測序引物序列,使得測序能與待測文庫片段結合,進而完成測序。

用在哪?p1接頭一般是在文庫構建中接到待測的片段上。另外在二代測序資料分析中,由於一些片段太短(比如你測序是測100bp,但是你的待測片段沒有100bp長度),使得測序結果中有接頭序列,我們在資料分析第一步中需要去除接頭序列。

不過很少見,一般情況下,測到的都是p2接頭,除非你的文庫構建的長度範圍比較廣,才有可能在read2的測序中測到p1接頭。

高通量測序中 p1接頭的作用及連線接頭反應原理 10

2樓:土豆檸檬絲

接頭在illumina中一般分為p5和p7接頭,其中一個帶有和flow cell上的探針反向互補的序列,以完成待測序列和探針結合的作用,另外一個接頭帶有barcord序列以區分不同的樣本。

連線接頭反應,其原理為序列打斷後加鹼基a,隨後接頭t單鹼基互補連線。

ngs測序中接頭起什麼作用

3樓:莫奇怪最帥

read是讀長,就是一個反應能測出的鹼基數 congtig是將很多read根據序列拼接在一起拼出的片段,理論上同一個染色體上的read結合起來拼出一個contig,但實際上做不到.contig中所以的鹼基序列是已知的 在高通量測序前,會構建一定長度的文庫(譬如8k的。

高通量測序中index什麼作用

4樓:**ile我的愛人

起區分各樣本資料的作用,每個樣本都有不同的index,在測序的時候會通過index 的不同將樣本的資料分開,形成不同的資料夾

高通量測序中建庫接頭的作用反應及原理

5樓:**ile我的愛人

接頭主要是為了測序,接頭上含有測序引物互補結合的片段序列,通過和測序引物結合來對目的片段進行測序

高通量測序分的原理是什麼?

6樓:天涯海角七樓號

對dna分子進行

序列測定。

1.對幾十萬到幾百萬條dna分子進行序列測定和一般讀長較短等為標誌。

2.根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等,主要有以下幾種:大規模平行簽名測序(massively parallel signature sequencing, mpss)、聚合酶克隆(polony sequencing)、454焦磷酸測序(454 pyrosequencing)、illumina (solexa) sequencing、abi solid sequencing、離子半導體測序(ion semiconductor sequencing)、dna 奈米球測序 (dna nanoball sequencing)等。

3.高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條dna分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細緻全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deep sequencing)。

參考資料

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