下一步要做real time pcr,逆轉錄引物怎麼選擇,隨

2021-04-17 13:04:38 字數 2681 閱讀 5231

1樓:傻蛋嘟嘟

顯然是選random primer更好,其bai實說明書是有du

寫的啦zhi,原因是rt-pcr逆轉錄是要得到一個dao所有的內rna的cdna庫,然後再容p出你要的「幾個基因」,所以不是每個基因的mrna都是有polya的,很多都是沒有的,microrna,pirna,很多都沒有哦,所以如果你用oligo dt引物,就自然會miss掉很多(確實是很多)的rna,而隨機引物不會有這個問題,用它反轉錄出來的cdna丰度更高,結果更加準確!!

普通pcr與real time pcr引物有區別嗎

2樓:幻之誰愚

熒光定量pcr,其引物和一般引物在構成上是沒內有什麼區別的,只

容是要更加註意引物二聚體、pcr產物大小等問題。染料法不需要其他東西,探針法還需要taqman探針,這個探針的設計是比較有講究的,並且上面有熒光集團和猝滅基團。

聚合酶鏈式反應是一種用於放大擴增特定的dn**段的分子生物學技術,它可看作是生物體外的特殊dna複製,pcr的最大特點,是能將微量的dna大幅增加。

3樓:匿名使用者

有區別,熒光定量pcr引物,特異性更高。

4樓:匿名使用者

real time pcr引物設計是有特殊要求的,是跨越內含子的。

5樓:匿名使用者

如果real time pcr用的是染料法,那麼引物和普通pcr沒有太大分別,只是產物大小盡量在100-300bp間

設計real-time pcr的引物,mrna有多個變體,應該如何選擇

6樓:阿魯巴星人

首先,你要明確你要檢測的是什麼。如果你需要檢測guanylate cyclase 1,並且包括它所有的transcripts,那你就在這些transcripts 的保守序列上(就是每個transcripts都包含的序列)設計引物。如果你要檢測某一個transcript,那你就在這個特異的序列上設計引物。

rt-pcr與時時pcr的原理及引物有什麼區別?

7樓:惟鏞

rt-pcr和一般的pcr相比原理上沒有太多的區別,無非就是在反轉時候rna的定量,不同模板的設定。對引物沒有特別的要求,能特異代表目的基因就行。

real-time pcr根據原理的不同,引物選擇也不同。通常用的是sybr green的方法,這種方法引物在rt-pcr的基礎上需要注意:1.

退火溫度同內參;2.片段長度不要超過200;

real-time pcr的引物可以跑rt-pcr,反之不一定。

8樓:匿名使用者

rt-pcr就是將rna先反轉錄為cdna,在將轉錄得到的cdna作為模板進行pcr反應擴增目標片段。用於反轉錄的引物根據實驗的具體情況選擇隨機引物、oligo dt及基因特異引物的一種。對於短的不具有髮卡結構的真核細胞mrna三種都可。

隨機引物:適用於長的具有髮卡結構的rna。適用於rrna、mrna、trna等所有rna的轉錄反應。主要用於單一模板的rt-pcr反應。

oligo dt:適用於具有polya尾巴的rna。(原核生物的rna、真核生物的 oligo dt rrna和trna不具有polya尾巴。

)由於oligo dt要結合到polya 尾巴上,所以對rna樣品的質量要求較高,即使有少量降解也 會使全長cdna合成量大大減少。

基因特異引物:與模板序列互補,適用於目的序列已知的情況。

實時pcr也就是qpcr的基本原理與pcr也是一樣的,只是在體系中加入熒光指示,可以對pcr的模板進行定量。

一種是加入熒光染料sybr green,sybr green會嵌入雙鏈dna的小溝,且只有在嵌入小溝時才會發出熒光,熒光定量pcr沒進行一個迴圈就會對產物進行一次檢測,通過檢測每個迴圈後熒光強度(間接得知dna的量)從而檢測整個pcr的過程,最後通過標準曲線對未知模板進行定量分析。sybr green不具有特異性,對結果稍有影響。

另一種是加入熒光探針taq man,pcr擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團。探針完整時,報告基團發射的熒光訊號被淬滅基團吸收;pcr擴增時,taqman探針在pcr體系中會與目標片段雜交,而在pcr的extension階段taq酶以一條鏈為模板合成目標片段,此時taq酶的5'-3'外切酶活性將結合在模板上的探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監測系統可接收到熒光訊號,即每擴增一條dna鏈,就有一個熒光分子形成,實現了熒光訊號的累積與pcr產物形成完全同步。taq man 特異性強,只有被擴增出目標片段時,才有熒光發出,但是**昂貴。

9樓:匿名使用者

一樓的~real-time pcr不就是rt-pcr嗎?!實時定量pcr

realtime pcr引物和一般引物有何不同

10樓:匿名使用者

如果你做來

的事熒光定量源pcr,其引物和一般引物在構成上是沒有什麼區別的,只是要更加註意引物二聚體、pcr產物大小等問題。染料法不需要其他東西,探針法還需要taqman探針,這個探針的設計是比較有講究的,並且上面有熒光集團和猝滅基團。具體設計,一般使用相關軟體進行。

11樓:此時情緒

上下游引物所擴增出來的片段應保證能涵蓋熒光探針。

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